Entré en 1978 à la commission européenne, François Lamoureux a été conseiller, puis Chef Adjoint du Cabinet du Président de la Commission européenne (Jacques Delors). Après avoir été Directeur Adjoint du Cabinet du Premier Ministre français de 1991/1992, il a rejoint la Commission européenne en 1993. Il a été Directeur général des transports et de l’énergie à la Commission européenne jusqu’en janvier 2006. Il est professeur au Collège Européen de Parme et à l’Université Bordeaux IV Montesquieu.
Il était Vice-président et membre du Conseil d’administration de l’Institut Jacques Delors.